В точке А получаешь время в UnixTime, в точке B получаешь время в UnixTime. Из второго UnixTime вычитаешь первый UnixTime и получаешь время в секундах.
Потом когда нужно запустить таймер - записываете дату в переменную, когда нужно остановить таймер, записываете дату сейчас в переменную2, потом снипетом минусуете переменную2 от переменная1 и выводите в нужном формате.
В точке А получаешь время в UnixTime, в точке B получаешь время в UnixTime. Из второго UnixTime вычитаешь первый UnixTime и получаешь время в секундах.