Как вариант, во входных настройках выбираете галочкой
1 путь - добавляете 1 задание, шаблон собирает в один поток
по завершению во входных выбираете 2 путь - и добавляете кучу заданий, которые отрабатываются в многопотоке.
Или же, если не хочется запускать вручную, делаете 2 отдельных шаблона. И ставите запуск второго в многопотоке после отработки первого в однопотоке
МОжет есть решение изящней, но мне оно не известно)