var file = project.Variables["Переменная1"].Value; // заносим сюда данные из переменной "Переменная1"
System.Diagnostics.ProcessStartInfo start =
new System.Diagnostics.ProcessStartInfo();
start.FileName = file;
start.WindowStyle = System.Diagnostics.ProcessWindowStyle.Hidden;
var process = System.Diagnostics.Process.Start(start );
process.WaitForExit();