Должен обновляться без проблем.
Что-то с Magisk похоже, попробуйте для начала восстановить его в первоначальное состояние, чтобы имя пакета стало com.topjohnwu.magisk
Если не поможет, лучше заново установить Magisk, по инструкциям к своему телефону. Тут не может быть какого-то универсального...