Как изменить значение по-умолчанию для переменной?

[che100]

А в чём сложность?
Просто вызываем примерно вот так:

project.Variables.GetType().GetMethod("CreateVariable").Invoke(project.Variables,new object[]{"name1","value2",VariableGroupTypeV4.UserDefined,true });

Получаем переменную в проекте:
Посмотреть вложение 92873

Так понятно.