Никто точно не ответит. подшаблоны разные бывают. Основной в это время (если не извращаться) останавливается, так что только памяти больше расходуется.
Создать тестовый шаблон с и без подпроектов и замерить результат... Это же не сложно... Включить трассировку, скачать анализатор трассировки, сделать статический анализ трассировки... Все есть же...
А вот посмотреть разницу между подпроектом и тем же шифрованным или опубликованном подпроекте... В той же трассировке... Советую.