Если кому то будет интересно решил проблему работы со вторым листом таким образом:
1. Переношу первый лист таблица с помощью стандартного кубика сохранение таблицы в файл. Получается отдельный файл с первым листом
2. С помощью C# кода удаляю первый лист по названию его
var fi=new FileInfo(@"E:\Загрузка в БД\files_xml\file.xlsx");
using (var p = new ExcelPackage(fi))
{
var ws=p.Workbook.Worksheets["Worksheet"];
ws.Workbook.Worksheets.Delete("Worksheet");
p.Save();
}
3. Как и в первом пункте делаю сохранение таблицы в другой файл
В итоге получается 2 файла с 2-мя страницами из исходного файла.
PS: Для манипуляций с таблицами через C# подключал dll библиотеку из темы
https://zennolab.com/discussion/threads/sozdanie-excel-fajlov.15797/
PSps: так же делаю предварительную перекодировку файла из excel 2003 в excel 2007. Потому как эта dll не может работать с файлами в 2003 офисе