Приятно читать слова благодарности, спасибо. Подружить с зенно можно либо переписав на C# (но тогда и шаблон нужно будет писать в CodeCreator'е), либо запускать батник самим зенно. Сделать это можно создав в ProjectMaker'е шаг Собственный код ==> Своя программа и указать путь к батнику. Но сначала его нужно отредактировать, добавив в самую первую строку запись вида cd <Путь к нужной папке>. Должно получиться что-то вроде этого.
cd "C:\folder\sub folder"
java -jar ImageCrop.jar
Путь к папке не должен содержать кириллические символы, только латиницу.