.Net не имеет API для выгрузки своих библиотек, но Win32 для обычных - имеет, только перед этим надо хорошо знать этот .Net, что происходит, что надо правильно остановить, где надо правильно подчистить...
Из-за подобного и используется переходник отладки VS/PM, который запускается и завершается...